Überblick
Die Hauptursache von Krankheiten ist leider meist der Halter: 
Fütterungsfehler und schlechte Haltungsbedingungen (zu kleines Gehege, falscher Standort, falsche Ausstattung), fehlende Hygiene und Pflege der Tiere. Dies alles führt zu einem schlechteren Allgemeinzustand und bietet Infekten oft erst eine Angriffsmöglichkeit.
Natürlich gilt dies nicht für alle Krankheiten: manche werden von anderen Tieren, infiziertem Futter oder Kot übertragen oder auch ganz unabsichtlich vom Mensch. Auch einige Erbkrankheiten existieren, wobei die Elterntiere unter Umständen ganz gesund scheinen.
Wenn Sie nicht wirklich Erfahrung in der Behandlung von Krankheiten haben, suchen Sie möglichst schnell einen Tierarzt (der sich günstigerweise mit Meerschweinchen auskennt) auf. Tipps hierzu finden Sie unter 
Tierarztwahl.
Die hier zu findende Alphabetische Liste von Krankheiten sowie die Diagnose können Ihnen nur Anhaltspunkte geben, ersetzen jedoch keinen Tierarztbesuch.
Fütterungsfehler und Folgen
Die meisten Fütterungsfehler (z.B. plötzliche Futterumstellung, Vorratsfütterung, zu wenig rohfaserreiches Futter) führen in allererster Linie zu Erkrankungen des Verdauungsapparates (wird in einem neuen Fenster geöffnet), vor allem Aufgasungen (Tympanie) oder Verstopfung (Obstipation). Durch überlagertes Futter können auch Mangelerscheinungen durch fehlende Vitamine auftreten.
Umgekehrt können einige Vitamine und Mineralstoffe (z.B. Vitamin D oder Calcium) bei Überversorgung ebenfalls zu schweren Erkrankungen führen.
Vitaminmangel
- Vitamin A
- enthalten in:
Möhren, Gurken, Löwenzahn, Petersilie, Rote Beete, sowie Grün- und Fertigfutter - Mangelerscheinung:
Bewegungsunlust, Krämpfe, Lähmungen, Atemnot, Hauterkrankungen (z.B. Ballenentzündungen), Wachstumstörungen, Augenerkrankungen - Vitamin B-Komplex:
- enthalten in:
Möhren, Löwenzahn, Rote Beete, Weizenkeimen sowie Grün- und Fertigfutter - Mangelerscheinung:
Darmerkrankungen, Blutarmut, Haarausfall, Krämpfe, Lähmungen, Wachstumstörungen, Abmagerung, Linsentrübung, Hautentzündungen - Vitamin C:
- enthalten in:
Petersilie, Gemüsepaprika, Äpfel, Löwenzahn, Kiwis, Mandarinen, Grün- und Fertigfutter - Mangelerscheinung:
Schwächung des Immunsystems, Erkältungen, innere Blutungen, Zahnfleischentzündungen (Skorbut), Zahnlockerungen - Vitamin D:
- enthalten in:
Möhren, Heu, Brennesseln, Grün- und Fertigfutter - Mangelerscheinung:
Rachitis (kommt selten vor), Jungtiersterblichkeit, Gefahr bei Überdosierung: Knochentkalkung - Vitamin E:
- enthalten in:
Möhren, Weizen, Grün- und Fertigfutter - Mangelerscheinung:
Wachstumsstörungen, Unfruchtbarkeit, Absterben von Jungtieren im Mutterleib, Gleichgewichtsstörungen, Lähmungen - Vitamin H:
- enthalten in:
Grün- und Fertigfutter allgemein, Hefe - Mangelerscheinung:
Infektionsanfälligkeit, Wachstumsstörungen, Hautentzündungen (z.B. Ballenentzündungen), Haarverlust - Vitamin K:
- enthalten in:
Möhren, Mais, Grün- und Fertigfutter - Mangelerscheinung:
Blutungen in Schleimhäuten (Nasenbluten) - Folsäure:
- enthalten in:
Heu, Grün- und Fertigfutter - Mangelerscheinung:
Wachstumsstörungen, Blutarmut